MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020054	ACC	2	6	520382	520387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_020054	A	6	6	520389	520394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020054	CTG	2	6	520402	520407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_020054	T	6	6	520590	520595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020054	AATCA	2	10	520596	520605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_020054	GCC	2	6	520609	520614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_020054	CAA	2	6	520654	520659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_020054	AATAT	2	10	520668	520677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020054	TTC	2	6	520727	520732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_020054	TTA	2	6	520733	520738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020054	ATA	2	6	520846	520851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020054	GCT	2	6	520852	520857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_020054	TTTA	2	8	520869	520876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020054	AAT	2	6	520879	520884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020054	ATT	2	6	520956	520961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020054	AC	3	6	520997	521002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_020054	ATC	2	6	521113	521118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_020054	CGT	2	6	521127	521132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_020054	T	6	6	521138	521143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020054	CGA	2	6	521144	521149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_020054	TA	3	6	521171	521176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020054	CATT	2	8	521247	521254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_020054	AGC	2	6	522265	522270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020054	GC	3	6	523086	523091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_020054	GTT	2	6	523224	523229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020054	CAG	2	6	526425	526430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020054	AGC	2	6	526462	526467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_020054	CGG	2	6	526471	526476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_020054	ATC	2	6	526545	526550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020054	ACA	2	6	526612	526617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_020054	CAG	2	6	526649	526654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_020054	CTA	2	6	528467	528472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_020054	CGA	2	6	528671	528676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_020054	TCG	2	6	528678	528683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_020054	CTC	3	9	528696	528704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_020054	TGAA	2	8	528754	528761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020054	AAC	2	6	529784	529789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020054	A	6	6	531814	531819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020054	GT	3	6	531927	531932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020054	A	7	7	531949	531955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020054	TCA	2	6	531970	531975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_020054	GCA	2	6	535137	535142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020054	A	6	6	535145	535150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020054	TA	3	6	537373	537378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020054	GGC	2	6	538645	538650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020054	CAGC	2	8	538670	538677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_020054	GAC	2	6	538700	538705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_020054	CCAA	2	8	538741	538748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_020054	TAG	2	6	539605	539610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020054	T	7	7	539651	539657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020054	TCA	2	6	539671	539676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020054	ATCGG	2	10	539743	539752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_020054	AGA	2	6	539757	539762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020054	TAA	2	6	539765	539770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020054	AAT	2	6	539814	539819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020054	GTT	2	6	539842	539847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020054	GCC	2	6	539878	539883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_020054	GGGGGC	2	12	540769	540780	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1059	NC_020054	GCT	2	6	541794	541799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_020054	GCAAA	2	10	542808	542817	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1061	NC_020054	CAA	2	6	542872	542877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_020054	CCG	2	6	542879	542884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_020054	TAA	2	6	545076	545081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020054	A	7	7	545119	545125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020054	A	6	6	545157	545162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020054	T	6	6	545179	545184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020054	GC	3	6	545527	545532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_020054	TAC	2	6	545538	545543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_020054	ACC	2	6	546153	546158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_020054	AT	3	6	547426	547431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020054	AT	3	6	547524	547529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020054	AAC	2	6	547585	547590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_020054	AAC	2	6	547642	547647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020054	GCC	2	6	548316	548321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_020054	TAG	2	6	548332	548337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020054	TGG	2	6	549690	549695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020054	TGC	2	6	549708	549713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_020054	TAG	2	6	549729	549734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020054	GTT	2	6	549801	549806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020054	CTT	2	6	549913	549918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_020054	ATC	2	6	549947	549952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_020054	TTA	2	6	549966	549971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020054	GTT	2	6	549972	549977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020054	ATC	2	6	549991	549996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_020054	ACC	2	6	550038	550043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_020054	CTTAC	2	10	550078	550087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_020054	TACC	2	8	550140	550147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_020054	TGGC	2	8	550160	550167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_020054	GTG	2	6	550215	550220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020054	GAC	2	6	550245	550250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_020054	TGA	2	6	552105	552110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020054	ACA	2	6	553111	553116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_020054	GCT	2	6	553124	553129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_020054	AGC	2	6	553140	553145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_020054	GCC	2	6	553187	553192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_020054	TTAA	2	8	553202	553209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020054	A	6	6	553305	553310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020054	ATT	2	6	554896	554901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020054	AC	3	6	554923	554928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_020054	CGC	2	6	557595	557600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_020054	AAG	2	6	561764	561769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020054	AAG	2	6	562060	562065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020054	A	6	6	562090	562095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020054	CCG	2	6	562105	562110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_020054	AACT	2	8	562115	562122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_020054	TGT	2	6	563331	563336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020054	GAG	2	6	563350	563355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020054	CGG	2	6	564350	564355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020054	CTG	2	6	565318	565323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_020054	GCT	2	6	565328	565333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_020054	GAC	2	6	568719	568724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_020054	AGC	2	6	571725	571730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_020054	TCA	2	6	571748	571753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_020054	TTA	2	6	571794	571799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020054	GTC	2	6	571807	571812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_020054	A	6	6	571925	571930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020054	GAG	2	6	571948	571953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020054	AGT	2	6	571981	571986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020054	TCT	2	6	573222	573227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_020054	TGT	2	6	574227	574232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020054	CCTA	2	8	575184	575191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_020054	TCA	2	6	575264	575269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_020054	GAC	2	6	575293	575298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020054	TGC	2	6	577415	577420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_020054	CAAA	2	8	577903	577910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_020054	A	6	6	577908	577913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020054	CAACT	2	10	577996	578005	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1128	NC_020054	GTA	2	6	578972	578977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020054	AACA	2	8	578992	578999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_020054	TAC	2	6	579010	579015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020054	GTG	2	6	579040	579045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020054	C	6	6	579133	579138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1133	NC_020054	CAG	2	6	579163	579168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020054	CAC	2	6	579220	579225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_020054	T	7	7	579235	579241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020054	ACG	2	6	580805	580810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_020054	ACT	2	6	580863	580868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1144	NC_020054	GAACA	2	10	582386	582395	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1151	NC_020054	GT	3	6	587269	587274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_020054	ACA	2	6	590864	590869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1250	NC_020054	GGT	2	6	610947	610952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_020054	TGGG	2	8	610959	610966	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_020054	CGT	2	6	611142	611147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1258	NC_020054	GAGCC	2	10	611404	611413	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1260	NC_020054	CT	3	6	611485	611490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1261	NC_020054	GAAC	2	8	611502	611509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_020054	TGG	2	6	611537	611542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_020054	ACG	2	6	611568	611573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_020054	CCA	2	6	611694	611699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1266	NC_020054	CGAT	2	8	611833	611840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1267	NC_020054	GCTGA	2	10	611846	611855	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1268	NC_020054	TGC	2	6	611895	611900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1270	NC_020054	TAC	2	6	611995	612000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_020054	TGGC	2	8	666625	666632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1404	NC_020054	CTA	2	6	666651	666656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_020054	T	6	6	668076	668081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_020054	AAAAT	2	10	668093	668102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_020054	GCAAT	2	10	668189	668198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1410	NC_020054	TGG	2	6	669583	669588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_020054	ATA	2	6	669622	669627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_020054	CCGC	2	8	670993	671000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1429	NC_020054	CCG	2	6	675806	675811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1431	NC_020054	ATT	2	6	676779	676784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_020054	A	6	6	677776	677781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_020054	GTG	2	6	679505	679510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_020054	ATT	2	6	692119	692124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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